Software Open Source (para animación)

Algunos programas útiles para introducirse en la animación

Para animación 2D
Pencil Traditional animation Software
MyPaint animation (solo Linux, y básicamente Ubuntu)
Synfig Studio (vectorial)
El GIMP tiene una serie de scripts y plugins que permite hacer animación.
Un software un poco abandonado pero que funciona bien es Ktoon.

Para animación 3D
Evidentemente, el mejor de todos es Blender , muy bien documentado en internet.

Para modelar, Wings 3D.
Si lo que buscas es solo animar, puedes buscar personajes preparados en muchos sitios de Internet  como:
 11 Second Club
Blender Swap
O con una simple busqueda en Google.

Para Stop Motion

Anazasi StopMotion Animator .
Stop Motion Animator.

Para linux existen una variedad de programas como Stopmotion, Luciole y Toonloop, deberiais buscarlo en vuestro programa de gestion de software como el Synaptic, Yum o Yast.